标蛋白u之间的功能相似

据方程式 计算这些邻居和目性。1 : 寸图像 蛋白质复合物是大分子组织的功能单元，由执行细胞生物学功能的相互作用蛋白质组成[ 17 ]。考虑到相关实验技术可能会导致蛋白质-蛋白质相互作用检测中出现假阳性结果，我们应用蛋白质复合物数据来评估蛋白质之间的模块相似性，以构建更可靠的蛋白质相互作用网络。令ms ( u , v ) 表示u和v之间交互的

模块相似度。然后，使用以下方程计算交互的模块相亚洲手机号码列表似度 (你| × |Cv| (2) 其中C u和C v分别表示包含u和v的蛋白质复合物集合。C u ∩ C v表示同时包含u和v的蛋白质复合物集合。最后，我们通过整合 PPI 网络和蛋白质复合物的拓扑结构，构建了一个高置信度的加权蛋白质-蛋白质相互作用网络。新构建的蛋白质-蛋白质


相互作用网络中蛋白质u和v之间的权重是它们的功能相似性和模块相似性的线性组合，定义为白质结构域关联网络 结构域是指蛋白质亚基结构的致密球形区域，由100~200个氨基酸残基组成，每个氨基酸残基具有独特的空间构象和不同的生物学功能。如果蛋白质u包含结构域d，则u将结构域dn与蛋白质结构域关联网络中的边连接，并且mpd ( u , dn ) = 1 ，否则，它们之间没有边，并